Gli interessi del Sarpi si vanno spostando, dalle ricerche naturali e scientifiche dei primi anni, verso l’indagine storica, in particolare riguardante la tradizione secolare di lotte con la Chiesa, alla luce delle funzioni che la nuova coscienza politica, specie a partire dalle analisi del Machiavelli, assegna allo Stato. Per Sarpi lo Stato si incarna nella tradizione politica ormai secolare della Repubblica di Venezia. Dopo la nomina nel 1606 a Teologo consultore dello Stato, Sarpi dedica tutto il suo impegno nel sostenere con i consigli e con gli scritti l’azione del Senato, difendendo infaticabilmente le ragioni della Repubblica.